Nel giorno dell'assassinio di Giovanni Maria, il 16 maggio 1412, i congiurati acclamarono i discendenti di Bernabò come loro Signori. Gian Carlo ed Estore Visconti, già alle porte di Milano in attesa dell'evento, entrarono in città ottenendo poi anche dal popolo milanese riunito in Duomo la conferma della loro investitura. Non riuscirono però ad assicurarsi il Castello di Porta Giovia tenuto dal castellano Vincenzo Marliani, che si dichiarò fedele al legittimo erede, Filippo Maria Visconti, fratello minore di Giovanni Maria.
Dopo pochi giorni l'esercito di Filippo Maria assediò Milano impedendone il vettovagliamento; il 16 giugno dello stesso anno, esattamente dopo un solo mese dall'assassinio di Giovanni Maria, l'esercito del fratello entrò in Milano scacciando i ribelli. Gian Carlo ed Estore si rifugiarono in Monza dove furono subito assediati dal nuovo Duca. Gian Carlo riuscì a rifugiarsi presso l'imperatore Sigismondo in Lussemburgo; Estore, colpito da una pietra scagliata da una bombarda, morì il 7 febbraio 1413.